Suomen Ilmailumuseo ottaa vastaan lähtökohtaisesti vain lahjoituksia yksityisiltä ihmisiltä ja yhteisöiltä. Museon kokoelmiin kuuluu ilma-alusten ja niiden osien lisäksi laajalti kotimaiseen ilmailuun liittyvää esineistöä, valokuvia, arkistoaineistoa ja kirjallisuutta. Valtaosa kokoelmista kuuluu Suomen Ilmailumuseosäätiön omistukseen, mutta aineistoa on hajanaisesti saatu myös erityyppisin talletussopimuksin.
Aineiston vastaanottamisesta tehdään aina harkintaa. Museo joutuu miettimään, kuinka materiaali sopii museon tallennussuunnitelmiin ja onko vastaavaa aineistoa jo entuudestaan museon kokoelmissa. Kummassakin tapauksessa voi osoittautua, että luovutus kannattaa ohjata toiseen museoon tai arkistoon.
Museon henkilökunta vastaa esineiden ja muun materiaalin käsittelystä, pakkaamisesta ja säilyttämisestä, digitoinnista, luetteloinnista ja kuljettamisesta. Lahjoitettua materiaalia luovutetaan museon ulkopuolelle näyttelykäyttöön vain kirjallisella museon ja lainaajan välisellä sopimuksella.
Esinelahjoituksista vastaa ensisijaisesti intendentti Matias Laitinen, toissijaisesti muu kokoelmahenkilökunta.